Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf3Q8CIN6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Celf3Q8CIN6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms