Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nav1Q8CH77 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nav1Q8CH77 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nav1Q8CH77 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms