Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc34Q8CFI2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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