Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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