Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms