Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup88Q8CEC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms