Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam228aQ8CDW1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam228aQ8CDW1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms