Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc9Q8CDN9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms