Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms