Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms