Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrn3Q8CBC6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn3Q8CBC6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms