Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms