Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TiparpQ8C1B2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TiparpQ8C1B2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms