Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsaQ8C0C7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms