Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh12Q8BYK4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms