Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms