Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx17Q8BVL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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