Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi44Q8BV66 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi44Q8BV66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms