Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130116L18RikQ8BMV6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms