Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy1Q8BIJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms