Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbfox3Q8BIF2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbfox3Q8BIF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbfox3Q8BIF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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