Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd4Q8BH32 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms