Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco3Q8BH01 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms