Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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