Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pknox2Q8BG99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms