Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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