Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramel6Q810Y9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramel6Q810Y9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel6Q810Y9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms