Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NfascQ810U3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms