Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmes1Q810Q5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmes1Q810Q5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms