Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc172Q810N9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms