Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Liat1Q810M6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Liat1Q810M6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms