Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms