Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc27Q80YS5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc27Q80YS5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms