Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms