Protein–RNA interactions for Protein: Q80YG3

Klhdc1, Kelch domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc1Q80YG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc1Q80YG3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms