Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sestd1Q80UK0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sestd1Q80UK0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms