Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
NischQ80TM9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NischQ80TM9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms