Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo1Q7TT28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo1Q7TT28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms