Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lamp3Q7TST5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms