Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms