Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2aQ7TSC1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms