Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ShprhQ7TPQ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ShprhQ7TPQ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 466.6 ms