Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prrc2bQ7TPM1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms