Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo2Q7TPD3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo2Q7TPD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo2Q7TPD3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms