Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV0

Dek, Protein DEK, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DekQ7TNV0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DekQ7TNV0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DekQ7TNV0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DekQ7TNV0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms