Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ScocQ78YZ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScocQ78YZ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms