Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eci3Q78JN3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms