Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms