Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sned1Q70E20 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms