Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.1 ms